在這一次石門水庫整治效益公聽會舉辦之前，一直認為石門水庫面臨最緊急的問題在於原水濁度不斷升高，不過在會中看到了一些新的資料，終於領悟到嚴重的淤積直接而立即的威脅到石門水庫的生存，而目前的整治方式不足以因應。在特別條例僅剩三年和一百多億的經費的情況下，應當專注在淤積的減低。更何況淤積的改善很有可能對於濁度也有所助益，因為許多人認為水庫底泥的問題會使濁度更不容易下降。 如果再加蹉跎，等到石門水庫報銷，那就只有再興建另一個水庫（也許這是為何水利界並不著急的原因，他們應當很想再建個水庫吧，立刻會有一大筆經費以供運用），屆時不但是一場生態浩劫，許多原住民的家園又要被侵奪，只會留下石門水庫集水區中一大堆不再有用處的防砂壩張嘴恥笑 (注意看防砂壩像不像大笑的嘴形) 臺灣的學者，立委以及公民對於整治效益的評估和監督是多麼的無知和無能。

在這一次的石門水庫整治計畫中, 所要達成的目的主要有兩個：其一為降低颱洪時水庫的濁度，以免影響供水。其次則是減少淤積以延長水庫壽命。在降低濁度方面，過去數十年來上游集水區一直在進行保育整治，但正如1996年賀伯颱風以來所顯示的狀況，只要遇到極大雨量，濁度還是會上升。因此在這次整治中，對於濁度問題的處理方針主要以水庫上層取水和下層排砂來解決。而集水區保育治理的目的便集中於降低淤積，在這方面，通常使用整治率來代表其成效。