馬莎颱風於94年8月4日侵襲臺灣，於石門水庫集水區累積降雨量達818公厘，洪峰流量高達每秒5,322立方公尺。颱風期間為確保水庫安全，管理中心即依據水庫進流量與集水區降雨狀況實施水庫洩洪，水庫沉積之淤積物與洪水挾帶入庫之泥砂於洩洪時伴隨洪水排出水庫，經推估由永久河道放水路、溢洪道與發電廠排放之泥砂重量分別為51.79、369.95、177.69萬噸。